在谈到育种工作时，马小军指出，由于药用植物种类有11146种之多，分布在从低等植物藻类、菌类、苔藓类、蕨类到高等植物的几乎所有科、目，而每种用量有限，许多药材还存在道地性，因此很难统一管理。另外，我国绝大部分药材仍没有育成品种，中药材生产的区域性、道地性，决定了每种药材至少需3~5个优良品种，才能覆盖生产，而新品种使用几年后又需要更新，这就需要国家加大科技投入，并充分发挥地方的积极性。

　　据介绍，2006年国家首次大规模启动了中药材优良品种选育的研究工作，共支持28种中药材的新品种选育。广西壮族自治区质监局已于2007年批准建立了广西壮族自治区药用植物种子质量检验站，该站作为国内第一个省级专业化的种子站，已有一批药用植物种子质量地方标准获得批准，并正在制定100多个中药材标准包括种子质量标准。

　　完善的法律法规体系是种子种苗标准化的保证。魏建和强调 ，种子的流通，应参照农作物种子的管理模式，在种子法的框架下，制订《中药材种子种苗管理条例》。只有依法管理种子的流通环节，才能从根本上杜绝假劣中药材种子种苗的泛滥，而禁止假劣种子种苗进入生产环节，可以减少土地、人力、财力等资源的浪费。只有让合法商户经营经国家有关部门鉴定准许推广的优质中药材种子种苗，才能从根本上提高中药材的质量。

　　专家们呼吁，国家主管部门应对中药材种子种苗规范化进行科学论证，制定出长期发展规划，并尽快组织修订科学的中药材评价指标；科技部门应将育种研究列入科研计划，研究成果由各级主管部门组织推广。只有尽快实现中药材种子种苗的标准化，才能从源头保证中药材的质量。